Francisco de Sousa Fernandes é Licenciado em Engenharia Civil pelo Instituto Superior Técnico e Mestre em Gestão e Administração de Empresas (MBA) pela Universidade dos Açores. É natural da freguesia da Sagrada Família, Luanda.
Ingressou na Engil em 1997, onde começou por desempenhar funções no sector de Planeamento e Controlo de Custos acompanhando a execução de diversas obras em toda a região centro e sul do país. Mais tarde colaborou no sector Comercial onde continuou a sua atividade nesta empresa a partir dos Açores.
Em 1999 passa a desempenhar funções de Direção de Obra em diversas obras da região, tendo igualmente exercido esta função nas empresas Marques e Eng. Luís Gomes. É nesta última que passa a coordenar os sectores comercial e de produção da empresa, assumindo as funções de diretor de produção desde 2009.
É atualmente diretor do Laboratório Regional de Engenharia Civil, cargo que desempenha desde 2012.
Foi coordenador ou membro de equipas de investigação em projetos de investigação regionais, nacionais e internacionais e foi responsável pela organização de diversos workshops e congressos de âmbito nacional e internacional, tendo participado como conferencista em congressos e encontros científicos da sua especialidade.
Participou em diversos cursos, seminários e conferências nas áreas de engenharia, sustentabilidade, certificação energética e gestão e desenvolveu, na função de projetista, diversos projetos de betão armado e águas e esgotos no âmbito da sua formação superior de base.
Membro Sénior da Ordem dos Engenheiros, é vogal de Direção da Sociedade Portuguesa de Engenharia Sísmica desde 2013, e presidente do Conselho Fiscal da Sociedade Portuguesa de Geotecnia desde 2020.
É titular de Certificado de Técnico Superior de Segurança e Higiene do Trabalho e Perito Qualificado no Sistema de Certificação Energética.
Entre 2014 e 2016 foi Coordenador da Estrutura de Missão e Acompanhamento da Carta Regional das Obras Públicas. É representante da Região Autónoma dos Açores e vogal do Conselho Fiscal do Fundo para o Desenvolvimento das Ciências de Construção desde 2013.